Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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SgcdP82347 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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SgcdP82347 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SgcdP82347 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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SgcdP82347 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SgcdP82347 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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SgcdP82347 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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SgcdP82347 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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SgcdP82347 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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SgcdP82347 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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