Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf6P62331 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf6P62331 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf6P62331 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf6P62331 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf6P62331 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf6P62331 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms