Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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