Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csrnp1P59054 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms