Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Strn4P58404 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Strn4P58404 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms