Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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