Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcanP55066 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcanP55066 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NcanP55066 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms