Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms