Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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