Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms