Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms