Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms