Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cav1P49817 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cav1P49817 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cav1P49817 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cav1P49817 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cav1P49817 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cav1P49817 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cav1P49817 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cav1P49817 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cav1P49817 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cav1P49817 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cav1P49817 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cav1P49817 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cav1P49817 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms