Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms