Protein–RNA interactions for Protein: P35428

Hes1, Transcription factor HES-1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes1P35428 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms