Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms