Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TP20293 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TP20293 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TP20293 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TP20293 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TP20293 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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TP20293 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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TP20293 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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TP20293 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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TP20293 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TP20293 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TP20293 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TP20293 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TP20293 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TP20293 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TP20293 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TP20293 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TP20293 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TP20293 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TP20293 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TP20293 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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