Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VimP20152 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VimP20152 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VimP20152 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VimP20152 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VimP20152 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VimP20152 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VimP20152 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VimP20152 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VimP20152 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VimP20152 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms