Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms