Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sdc1P18828 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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