Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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