Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC8.34□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms