Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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DmdP11531 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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DmdP11531 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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DmdP11531 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DmdP11531 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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DmdP11531 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DmdP11531 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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DmdP11531 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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DmdP11531 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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DmdP11531 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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DmdP11531 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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DmdP11531 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms