Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxa5P09021 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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