Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TtrP07309 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms