Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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PdgfrbP05622 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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