Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms