Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms