Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Atf6bO35451 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Atf6bO35451 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Atf6bO35451 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Atf6bO35451 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Atf6bO35451 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Atf6bO35451 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Atf6bO35451 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Atf6bO35451 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Atf6bO35451 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atf6bO35451 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Atf6bO35451 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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