Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MsmbO08540 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MsmbO08540 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms