Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm17078M0QW51 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm17078M0QW51 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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