Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl4M0QW46 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms