Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm20878L7N244 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm20878L7N244 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm20878L7N244 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm20878L7N244 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm20878L7N244 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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