Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccer2J3QPU5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccer2J3QPU5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccer2J3QPU5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccer2J3QPU5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccer2J3QPU5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccer2J3QPU5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccer2J3QPU5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccer2J3QPU5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccer2J3QPU5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccer2J3QPU5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccer2J3QPU5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccer2J3QPU5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccer2J3QPU5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccer2J3QPU5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccer2J3QPU5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccer2J3QPU5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccer2J3QPU5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms