Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms