Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21060J3KMU4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms