Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms