Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LctF8VPT3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms