Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M1F7CXU4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms