Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21977F6U3N7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms