Protein–RNA interactions for Protein: F6RSK3

Gm17430, Predicted gene, 17430, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17430F6RSK3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17430F6RSK3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms