Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms