Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms