Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5478D3Z6R0 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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