Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms