Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms