Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms