Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms