Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Shisal2aA2A9G7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms