Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR0

Mmp16, Matrix metalloproteinase-16, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp16Q9WTR0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Mmp16Q9WTR0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Mmp16Q9WTR0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mmp16Q9WTR0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mmp16Q9WTR0 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mmp16Q9WTR0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mmp16Q9WTR0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp16Q9WTR0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mmp16Q9WTR0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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